Forces Shogunales
Shinsengumi: Affiliation de guerriers d'élite faisant office de milice et de groupe d'intervention militaire.
Oniwabanshu: Clan de Ninja au service du Shogun, connus pour leurs tactiques imprévisibles.
Bakufu (Gouvernement): Gouvernement central, formé de politiciens et de marchands.
Patriotes Impérialistes
Kyuushingumi (Radicaux): Comprenant les Hitokiris, les terroristes et les guerrileurs, ce groupe croient en la victoire par la force.
Gakusha (Pacifistes): Formé d'érudits et de marchands, le Gakusha vise la diplomatie pour arriver à leurs fins. Ils sont toutefois plus que contents de travailler avec le Kyuushingumi.
Clans Neutres
Dasanteki (Mercenaires): Plus ou moins une organisation de mercenaires autonomes, se regroupant en temps normal afin de garantir une certaine protection à ses membre.
Shinobi Chuukai: Agence de ninja. Donnez un contrat à l'un de leurs porte-parole (si vous en connaissez un, bien sûr) et le travail sera fait... Pour un prix donné...
Öfuu-han (Occidentaux) / Banjin (Barbares): Occidentaux prenant part au conflit. Rapellez-vous, nous sommes en 1866, pas de vikings ici, mais plutôt des militaires en uniforme, rapière ou sabre à la ceinture. Ou encore des diplomates/touristes.